Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLF2Q8IX21 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLF2Q8IX21 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms