Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NME9Q86XW9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NME9Q86XW9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NME9Q86XW9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms