Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM50Q86XT4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM50Q86XT4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms