Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
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