Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT28Q7Z3Y7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT28Q7Z3Y7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms