Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTF1AQ7RTS3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms