Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOP1Q7RTM1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms