Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP43Q70EL4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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USP43Q70EL4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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USP43Q70EL4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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