Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC73Q6ZRK6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms