Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TREML4Q6UXN2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms