Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC4A10Q6U841 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC4A10Q6U841 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms