Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC171Q6TFL3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC171Q6TFL3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms