Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD2Q6P5Q4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms