Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAVIN1Q6NZI2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms