Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPPQ6IPU0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms