Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WSCD1Q658N2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms