Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
USPL1Q5W0Q7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USPL1Q5W0Q7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms