Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SHEQ5VZ18 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SHEQ5VZ18 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms