Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GKAP1Q5VSY0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GKAP1Q5VSY0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GKAP1Q5VSY0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms