Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBXN11Q5T124 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms