Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms