Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PITRM1Q5JRX3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITRM1Q5JRX3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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