Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF542PQ5EBM4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF542PQ5EBM4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms