Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCAF6Q58WW2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF6Q58WW2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms