Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN3Q4LDR2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN3Q4LDR2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms