Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC153Q494R4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC153Q494R4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms