Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TTLL9Q3SXZ7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms