Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A8Q2Y0W8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A8Q2Y0W8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms