Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL40Q2TBA0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL40Q2TBA0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms