Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGSM1Q2NKQ1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM1Q2NKQ1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms