Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms