Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
QSER1Q2KHR3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
QSER1Q2KHR3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms