Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNOP1Q1ED39 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNOP1Q1ED39 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms