Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP2B3Q16720 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
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