Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTRK2Q16620 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK2Q16620 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms