Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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