Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRNA2Q15822 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms