Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
NCOA1Q15788 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
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NCOA1Q15788 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
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NCOA1Q15788 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NCOA1Q15788 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
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