Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HERC1Q15751 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
HERC1Q15751 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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