Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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LAPTM4AQ15012 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
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LAPTM4AQ15012 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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LAPTM4AQ15012 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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LAPTM4AQ15012 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LAPTM4AQ15012 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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LAPTM4AQ15012 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LAPTM4AQ15012 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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