Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
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