Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GAPVD1Q14C86 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GAPVD1Q14C86 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GAPVD1Q14C86 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
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