Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ALCAMQ13740 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ALCAMQ13740 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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