Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1orf61Q13536 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1orf61Q13536 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1orf61Q13536 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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