Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PICALMQ13492 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PICALMQ13492 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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