Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TOP3AQ13472 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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