Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXE3Q13461 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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