Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SP140Q13342 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SP140Q13342 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SP140Q13342 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP140Q13342 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP140Q13342 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP140Q13342 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP140Q13342 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP140Q13342 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP140Q13342 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP140Q13342 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP140Q13342 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP140Q13342 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP140Q13342 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SP140Q13342 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP140Q13342 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP140Q13342 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP140Q13342 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP140Q13342 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP140Q13342 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP140Q13342 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP140Q13342 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP140Q13342 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP140Q13342 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SP140Q13342 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP140Q13342 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP140Q13342 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP140Q13342 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP140Q13342 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP140Q13342 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP140Q13342 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP140Q13342 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SP140Q13342 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
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SP140Q13342 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SP140Q13342 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SP140Q13342 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP140Q13342 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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