Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA3FQ13275 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEMA3FQ13275 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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