Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF5Q13243 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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